精益六西格玛项目一般分为自上而下、自下而上和标杆分析三种方法。
1、自上而下选择法（战略分解法）
     经营层通过战略层层分解而选出的六西格玛项目。通过对经营环境分析确定组织的愿景，定义关键战略，规划出战略性目标（战略性市场目标、质量目标、压法目标、人力资源目标等），然后把战略目标分解为短期可实现的子目标。根据子目标展开年度目标，再结合组织的绩效和KPI选择精益六西格玛项目。
1）愿景——组织未来期望达到的一种状态。必须强调以顾客为中心的价值。
使命——组织存在的理由或目的，回答要做什么和服务于谁。
2）制定关键战略：将愿景分解为少数几个关键战略。可从以下几个方面评价：
—顾客忠诚和顾客满意
—不良质量成本
—组织文化
—内部业务过程
—竞争性标杆分析
3）确定中长期目标（1-3年内必须实现的任务）
     目标制定要符合SMART原则。
4）目标展开
5）精益六西格玛项目的选择

2、自下而上的选择
1）从个人工作或车间现场，找出不合理、出错率或不良率较高的进行改善；仔细梳理做事的流程，把平时发现的问题通过归类整理形成自下而上的项目；
2）借助日常统计报表或流程数据进行分析、查找改善机会。通过ERP进行不良率改善，提升生产效率；报废减少等。通过财务系统数据找到支出较大，费用较高的问题进行改善
3）通过客户的投诉和抱怨，筛选出合适的课题。
4）利用集体的智慧。每个部门提出困扰部门绩效的主要问题，解决了选题难的问题。
标杆分析法选项：将本企业各项活动的关键绩效指标与从事该项活动最佳者绩效指标进行比较，找出差距，成立精益六西格玛项目组进行改善
标杆分析法流程：

3标杆项目选择
1）确定分析标杆内容：可分为内部标杆分析、竞争标杆分析、职能标杆分析、一般标杆分析和联合标杆分析五种类型。
2）确定标杆分析对象：内部标杆分析对象、竞争者标杆分析对象和职能标杆分析对象；
3）数据收集和调研：（数据分为计数型和计量型两种）
4）分析绩效差距：分析时注意双方测量指标定义、测试方法、测量条件以及单位必须一致。
5）确定绩效目标：
6）成立精益六西格玛项目组
     在成立项目组之前，通过评估必要性和可行性，资源的投入和财务收益预计是必须要考虑的因素。
7）精益六西格玛项目实施 按照DMAIC或DMDOV进行。
8）结果评估和维持。从项目完成质量、周期、财务收益和人才培养多方便进行。维持项目收益包括控制和推广，运用SPC、防错法、文件化、制度化等方式使项目收益固化下来。
9）重新制定新的标杆水平：重新标杆分析的频率取决于行业变化的快慢和组织内部资源情况。一般一年一次较为合理，但是遇到特殊情况除外（组织发生某种危机、创新需要或者组织战略大调整等）。